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叶蓁蓁想起之前儿童福利中心爆发的出血热疫情,当时就是整晚没睡地做实验,现在再听王亚楠的诉苦,感同身受地笑了笑,“嗯,一样啊。”
想起这次来G省的任务,叶蓁蓁主动要求说:“从百子村死者标本分离出来的炭疽杆菌,你们做了序列分析吧?”
“嗯,昨天刚做了初步序列分析,叶老师,你想看结果?”
“是的,昨晚在报告会上,主讲人说过,这次分离出来的炭疽菌株跟B市之前流行的菌株,同源性很低,那跟这次菌株同源性最高的菌株是在哪个流行区分离出来的?”
王亚楠摇摇头,“昨天跟国内几个流行株做了初步比对分析,没有跟这次分离到的菌株同源性超过百分之九十的。”
“什么?同源性这么低!按照现在的数据,它都可以单列一个菌种了。”
“是啊,这就是这次疫情奇怪的地方,要不,我们G省疾控也不会向国家CDC求助了,刚才就算叶老师不提这件事,我也要带你去看昨天做出来的序列分析图呢。”
“好,现在就去。”
叶蓁蓁匆忙扒完碗里的饭,催促着王亚楠去实验室,每次遇到这种奇怪的实验现象,叶蓁蓁和南之乔的反应一样,激动又兴奋。
王亚楠带着叶蓁蓁去了实验楼的计算机房,所有需要进行序列分析,建立进化树,基因测序的后续工作都在计算机房完成。
G省疾控计算机房规模颇大,六七十平米的房间里放着八台电脑,西面还放着一排文件柜,柜子前是一排办公桌,很空旷的感觉。
计算机房里已经有两个人坐在电脑前,王亚楠带着叶蓁蓁走进机房,众人点点头算是打过招呼。
王亚楠在一台电脑坐下,打开电脑,随手拖过来一张旋转椅让叶蓁蓁坐在旁边。
叶蓁蓁坐在一旁,看着王亚楠从电脑中调出昨天做出的炭疽杆菌序列图,看了两眼,叶蓁蓁就发现了问题,一个单独的序列突出在众序列之外,序列后面用英文标注着毒株名称,Baizi anthracis ,叶蓁蓁指着电脑屏幕上单突出来的序列,问:“这就是从百子村死者身上分离出来的炭疽杆菌吧?”
“是的,下面这些是从国内各个炭疽流行区选出来的具有代表性的序列,对比分析后,从百子村新分离出来的这株炭疽杆菌因为与其他的同源性太低,所以系统软件将其单列出来一个分支。”周亚楠一边盯着电脑屏幕,一边用纳闷的口气说,“这就是这次炭疽疫情最奇怪的地方。”
叶蓁蓁心想,不会是新出现的变异株吧?每次细菌或病毒发生大的变异时,致病力都会发生相应的改变,这次百子村的祖孙四人发病急,症状严重,可能就是因为新出现的炭疽杆菌发生变异的缘故。
叶蓁蓁说出自己的想法,周亚楠点点头,解释说:“这个变异的可能,我之前也想过,所以打算今天对其中的几个毒力基因做一下分析。”
周亚楠开始调出各种炭疽杆菌的毒力基因,开始对比分析,边操作软件边说:“我们G省疾控用的这些序列分析软件还是南主任推荐的,分析方法也是之前去中国CDC统一培训过的,叶老师,这套分析软件和方法您也很熟悉吧?”
“嗯,这套分析软件是现在国际通用的,发表SCI论文的时候也认可这种方法。”
叶蓁蓁心想着,这套分析方法最初还是南之乔在巴黎的巴斯德研究所教会了自己,后来到了中国CDC南之乔的实验组,用的就更频繁了,每次做各种病毒的进化树,南之乔总是要求将国际上所有分离测序出来的代表毒株都放进进化树里,说是这样能全面分析,发现一些意想不到的东西……
想到这里,叶蓁蓁突然灵机一动,兴奋地对身旁的王亚楠说:“百子村分离出来的菌株,怎么没有跟国外其他地区的流行株做一下对比分析?”
王亚楠愣了一下,闷闷地解释:“这两年G省都没有发现炭疽疫情,这次突然来了几个病例,从发现到分离出菌株,再到测序,不过两天时间,我临时从Gene Bank 中下载了几条国内炭疽杆菌的序列,就匆匆做了比对……”
明白了,就是时间匆忙,还没来得及做的意思,叶蓁蓁终于找到能帮得上忙的地方了,“我来下载全球炭疽杆菌序列,做全序列对比分析,哪台电脑能用?”
“这两台都可以,可以上网下载序列,也安装了序列分析软件。”周亚楠指着身旁的两台电脑。
叶蓁蓁选了一台,开始干活,进入Gene Bank 先选择炭疽杆菌,再按地区开始下载。
刚下载了两条序列,寂静的计算机房里,突然一阵刺耳的手机铃声,叶蓁蓁被吓了一跳,回头一看,周亚楠已经接通手机。
听着手机里传来的消息,周亚楠脸色越来越沉重,几十秒之后,周亚楠一副紧急备战的状态,站起身,向叶蓁蓁说:“叶老师,又有一起疑似炭疽疫情,死了一家六口,今早刚被发现的,标本正在送来的路上,我先去实验室准备一下,这里就交给你了。”
“好,你去忙吧,这里毒力基因和全序列分析比对都交给我。”叶蓁蓁痛快地答应。
叶蓁蓁对这次突然死了六个人的疑似炭疽疫情很好奇,趁周亚楠还未走出机房,叶蓁蓁追问:“这次新的死亡病例也是在百子村吗?”
周亚楠停住脚,回头说:“不是,不过离百子村很近,是百子村隔壁的一个村庄,好像叫炮楼村,再具体的情况我也不知道。”
第8章 奇特现象()
发现新病例的地方离最早爆发疫情的百子村不远,两者一定有联系,还有南之乔去B市城区要处理的炭疽疫情,跟两个村庄的疫情可能也有联系。
叶蓁蓁自顾想着各种可能,眼角瞥见周亚楠已经离开机房,朝实验室的方向跑去,叶蓁蓁随口感慨了一句,“疫情一来,大家都忙得马不停蹄啊。”
叶蓁蓁也加快速度整理着下载下来的炭疽菌株序列,紧接着用软件分析,一番运算下来,序列对比图很快出现在电脑屏幕上。
看着电脑屏幕上的序列对比图,百子村分离出来的炭疽菌株竟然跟东南亚的一个流行株同源性很近,两个菌株分到了进化树同一区域,同源性高达百分之九十九点九。
这说明什么呢?这么高的同源性,说明这两个菌株出自同一自然疫区。可是,东南亚流行的菌株怎么会跑到百子村?是迁移的动物,还是旅游的人群带来的?
不管原因是什么,现在所有的想法都是推测,要最终确定原因,还是要靠南学长那边的现场调查。
叶蓁蓁拿起手机,拨通南之乔的电话,把自己分析出来的结果详细说了一遍,南之乔也微微有些惊讶,嘱咐叶蓁蓁把今天刚送来的B市城区和炮楼村两起疫情的标本也进行序列分析,做出进化树,尽快告诉他结果。
叶蓁蓁加快手上分析的速度,同时也跟周亚楠及时联系,当天晚上,B市城区病人的结果出来,第二天凌晨,炮楼村一家六口的结果也出来了,叶蓁蓁对几株炭疽菌株一起进行序列分析,完整的进化树在第二天中午全部出现在电脑屏幕上。
叶蓁蓁皱着眉头,盯着屏幕,整个炭疽杆菌的进化树,以序列同源性远近进行分支,百子村分离出来的菌株跟东南亚的炭疽流行株在一个分支上,而B市城区和炮楼村分离出来的菌株同源性非常高,且都跟日本地区流行的炭疽菌株在同一进化支上。
百子村和炮楼村都是G省B市辖区内的两个自然村,两个村子又是紧挨着,同时出现炭疽疫情,两者之间肯定有联系,可是,百子村分离出来的炭疽菌株跟东南亚地区的流行株同源性最近,而炮楼村和B市城区分离出的炭疽菌株跟日本地区的流行株同源性最近,如此奇怪的现象,叶蓁蓁还是第一次发现,嘴里不由地小声嘀咕道:“诡异……”
不管这种现象为什么这么诡异奇怪,先通知南学长再说。
叶蓁蓁坐在G省疾控中心实验大楼计算机房的电脑屏幕前,拨通南之乔的手机号码,手机里传来南之乔充满磁性的声音,“蓁蓁,什么事?”
叶蓁蓁直接进入正题,将自己这几天来做出的分析结果详细地说了一遍,还把电脑分析的序列对比图、进化树,以及自己心中对结果的疑问,都说了出来。
听完叶蓁蓁的陈述,手机一端的南之乔微微一顿,没有对结果提出疑问,而是反问:“蓁蓁,你现在还在计算机房?”
“是啊,电脑分析结果刚出来,我就直接给你打电话汇报了,怎么样?我连夜加班做出来的,速度还可以吧,希望对你们的现场调查有帮助。”
“很好,你先去吃午饭吧。”
南之乔难得在工作上表扬叶蓁蓁,蓁蓁心里顿时高兴起来,一连两天加班的疲累,因为南之乔一句“很好”,仿佛都烟消云散,浑身又充满了干劲,真希望现在能到疫情现场,跟在南学长身旁,叶蓁蓁带着希望问:“南学长,我在G省疾控中心这边的工作都做完了,能不能跟你一起去疫情现场啊?”
南之乔没有直接答应,“你先吃午饭吧,以后的工作安排,下午再说。”
叶蓁蓁低头瞟了一眼手腕上的机械表,已经是中午十二点十分,难怪肚子饿得咕咕叫,可是,如果南学长不答应自己去现场,又没有新的病例标本送来的话,下午就没什么事了,现在分析的结果充满疑问,又不能去现场,叶蓁蓁只觉得心里有些空落落的难受,“好吧,我先去吃午饭了。”
“好,再见。”
南之乔就要挂断电话,叶蓁蓁忍不住心中对上午分析结果的疑问,追问道:“等一等,南学长,你对刚才我汇报的分析结果有什么看法?对出来这种奇怪的结果,你有什么理论或事例能解释这种情况吗?”
“目前这种情况,排除测序或计算